„Autographiviridae“ – Versionsunterschied
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* [[Familie (Biologie)|Familie]] ''Autographiviridae'' (veraltet: ''Autographivirinae'', ''T7-Supergruppe'') |
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Version vom 5. Februar 2021, 18:46 Uhr
| Escherichia-Virus T7 | ||||||||||||||
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Escherichia-Virus T7 | ||||||||||||||
| Systematik | ||||||||||||||
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| Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||
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| Autographiviridae | ||||||||||||||
| Links | ||||||||||||||
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Die Autographiviridae (veraltet auch Autographivirinae, T7-Supergruppe, englisch T7 supergroup genannt) sind eine Familie von Viren in der Ordnung Caudovirales – sie wurden dort früher als Unterfamilie Autographivirinae in der Familie Podoviridae geführt. Ihre natürlichen Wirte sind Bakterien. Es gibt derzeit 40 Arten (Spezies) in dieser Unterfamilie, die meisten davon sind einer von sieben Gattungen zugewiesen.[2][3]
Forschungsgeschichte
Seit den 1990er Jahren hat sich der Begriff ‚T7-Supergruppe‘ für die wachsende Gruppe der mit dem Coliphagen T7 verwandten Bakteriophagen der Familie Podoviridae etabliert. Salmonella virus SP6 (alias Enterobacteriaceae-Phage SP6) und Escherichia virus K1-5 (alias Enterobacteriaceae-Phage K1-5) wurden als erste als eine weitläufig verwandte Untergruppe (die heutige Gattung Zindervirus) dieser ‚T7-Supergruppe‘ betrachtet.[4] Das Pseudomonas-Virus phiKMV (alias Bakteriophage phiKMV) zeigte auf der Ebene der Genomorganisation ebenfalls Gemeinsamkeiten. Basierend auf den verfügbaren morphologischen und proteomischen Daten wurde diese Virusklade als eine Unterfamilie in der Familie Podoviridae etabliert.
Etymologie
Der Name der Unterfamilie Autographiviridae kommt von griechisch αὐτο-γράφειν (aúto-gráphein, selbst-schreibend) und bezieht darauf, dass diese Phagen ihre eigene RNA-Polymerase kodieren, also selbst-transkribierend sind; dies ist ein gemeinsames Merkmal all ihrer Mitglieder.
Aufbau
Die Virusteilchen (Virionen) der Autographiviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischem Kopf-Schwanz-Aufbau und eine Symmetrie (Triangulationszahl) T=7. Der Durchmesser beträgt ca. 60 nm. Das Genom ist linear und hat eine Länge von ca. 40–42 kb.[2]
Vermehrungszyklus
Die Virusreplikation geschieht im Zytoplasma. Das Virus tritt durch Lyse (Auflösung) der Wirtszelle vermöge Holin-, Endolysin- bzw. Spanin-Proteinen aus dieser aus. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[2]
Systematik
Die folgende Liste führt die Spezies in der Unterfamilie Autographiviridae auf gemäß der ICTV Master Species List (MSL) #35 2019 v1:[5]
- Familie Autographiviridae (veraltet: Autographivirinae, T7-Supergruppe)
- Unterfamilie Beijerinckvirinae
-
- Spezies Acinetobacter virus Acibel007 (*)
- Gattung Friunavirus (alias Fri1virus)
- Spezies Acinetobacter-Virus AB3
- Spezies Acinetobacter-Virus Abp1
- Spezies Acinetobacter-Virus Fri1 (*)
- Spezies Acinetobacter-Virus IME200
- Spezies Acinetobacter-Virus PD6A3
- Spezies Acinetobacter-Virus PDAB9
- Spezies Acinetobacter-Virus phiAB1
- Gattung Pettyvirus
- Spezies Acinetobacter virus Petty (*)
- Unterfamilie Colwellvirinae
- Gattung Gutovirus
- Spezies Vibrio virus Vc1 (*)
- Gattung Kaohsiungvirus
- Spezies Vibrio virus A318 (*)
- Gattung Murciavirus
- Spezies Marinomonas virus CB5A (*)
- Gattung Trungvirus
- Spezies Vibrio virus VEN (*)
- Gattung Uliginvirus
- Spezies Pseudomonas virus uligo (*)
- Unterfamilie Corkvirinae
- Gattung Kantovirus
- Spezies Pseudomonas virus C171 (*)
- Gattung Kotilavirus
- Spezies Pectobacterium virus PP16 (*)
- Gattung Phimunavirus (*)
- Spezies Pectobacterium virus fM1 (*)
- Gattung Stompvirus
- Spezies Dickeya virus BF25-12 (*)
- Unterfamilie Krylovirinae
- Gattung Kirikabuvirus
- Spezies Pseudomonas virus NV3 (*)
- Gattung Phikmvvirus (alias Phikmvlikevirus, PhiKMV-ähnliche Viren)
- Spezies Pantoea-Virus Limelight (alias Pantoea-Phage Limelight)
- Spezies Pantoea-Virus Limezero (alias Pantoea-Phage Limezero)
- Spezies Pseudomonas-Virus LKA1 (alias Pseudomonas-Phage LKA1)
- Spezies Pseudomonas-Virus phiKMV (alias Pseudomonasa-Phage phiKMV, *)
- Gattung Stubburvirus
- Spezies Pseudomonas virus LKA1 (*)
- Gattung Tunggulvirus (ICTV-Fehlschreibung „Tunggulviirus“ korrigiert nach den ICTV-Regeln für Gattungsnamen)
- Spezies Pseudomonas virus f2 (*)
- Unterfamilie Melnykvirinae
- Gattung Aerosvirus
- Spezies Aeromonas virus AS7 (alias Aeromonas-Phage phiAS7, *)[6]
- Gattung Aghbyvirus
- Spezies Yersinia virus ISAO8 (*)
- Gattung Ahphunavirus
- Spezies Aeromonas virus Ahp1 (*)
- Gattung Cronosvirus
- Spezies Cronobacter virus GAP227 (alias Cronobacter-sakazakii-Phage vB_CsaP_GAP227, *)[6]
- Gattung Panjvirus
- Spezies Salmonella virus Spp16 (*)
- Gattung Pienvirus
- Spezies Yersinia virus R8-01 (alias Yersinia-Phage ϕR8-01, *)[6]
- Gattung Pokrovskaiavirus
- Spezies Yersinia virus Phi80-18 (alias Yersinia-Phage ϕ80-18, *)[6]
- Gattung Wanjuvirus (*)
- Unterfamilie Molineuxvirinae
- Gattung Acadevirus
- Spezies Proteus virus PM85 (*)
- Gattung Axomammavirus (*)
- Spezies Pectobacterium virus PP1 (*)
- Gattung Eracentumvirus
- Spezies Erwinia virus Era103 (*)
- Gattung Tuodvirus
- Spezies Lelliottia virus phD2B (*)
- Gattung Vectrevirus
- Spezies Escherichia virus VEc3 (*)
- Gattung Zindervirus (alias Sp6virus, Sp6likevirus, SP6-ähnliche Viren)
- Spezies Erwinia-Virus Era103 (alias Erwinia-amylovora-Phage Era103)
- Spezies Escherichia-Virus K5 (alias Enterobacteria-Phage K5)
- Spezies Escherichia-Virus K1-5 (alias Enterobacteria-Phage K1-5)
- Spezies Escherichia-Virus K1E (alias Enterobacteria-Phage K1E)
- Spezies Salmonella-Virus SP6 (alias Enterobacteria-Phage SP6, *)
- Unterfamilie Okabevirinae
- Gattung Ampunavirus
- Spezies Burkholderia virus BpAMP1 (*)
- Gattung Higashivirus
- Spezies Ralstonia virus RSB1 (*)
- Gattung Mguuvirus
- Spezies Burkholderia virus JG068 (*)
- Gattung Risjevirus
- Spezies Ralstonia virus RSJ2 (*)
- Gattung Sukuvirus
- Spezies Ralstonia virus RSPII1 (*)
- Unterfamilie Slopekvirinae
- Gattung Bucovirus
- Spezies Shigella virus Buco (*)
- Gattung Drulisvirus (alias Kp34virus)
- Spezies Klebsiella-Virus F19
- Spezies Klebsiella-Virus K244
- Spezies Klebsiella-Virus Kp2
- Spezies Klebsiella-Virus KP34 (*)
- Spezies Klebsiella-Virus KpV41
- Spezies Klebsiella-Virus KpV71
- Spezies Klebsiella-Virus KpV475
- Spezies Klebsiella-Virus SU503
- Spezies Klebsiella-Virus SU552A
- Gattung Koutsourovirus
- Spezies Enterobacter virus KDA1 (*)
- Gattung Novosibovirus
- Spezies Proteus virus PM16 (*)
- Unterfamilie Studiervirinae
- Gattung Aarhusvirus
- Spezies Dickeya virus Dagda (*)
- Gattung Apdecimavirus
- Spezies Yersinia virus AP10 (*)
- Gattung Berlinvirus
- Spezies Yersinia virus Berlin (*)
- Gattung Caroctavirus
- Spezies Citrobacter virus CR8 (*)
- Gattung Chatterjeevirus
- Spezies Vibrio virus N4 (*)
- Gattung Eapunavirus
- Spezies Enterobacter virus Eap1 (*)
- Gattung Elunavirus
- Spezies Erwinia virus L1 (*)
- Gattung Foetvirus
- Spezies Escherichia virus SRT7 (*)
- Gattung Ghunavirus
- Spezies Pseudomonas virus gh1 (*)
- Gattung Helsettvirus
- Spezies Yersinia virus fPS9 (*)
- Gattung Jarilovirus
- Spezies Pectobacterium virus Jarilo (*)
- Gattung Kayfunavirus
- Spezies Escherichia virus K1F (*)
- Gattung Minipunavirus
- Spezies Morganella virus MmP1 (*)
- Gattung Ningirsuvirus
- Spezies Dickeya virus Ninurta (*)
- Gattung Pektosvirus
- Spezies Pectobacterium virus PP81 (*)
- Gattung Phutvirus
- Spezies Pseudomonas virus PPpW4 (*)
- Gattung Pifdecavirus
- Spezies Pseudomonas virus Pf10 (*)
- Gattung Pijolavirus
- Spezies Pseudomonas virus PspYZU08 (*)
- Gattung Przondovirus (alias Kp32virus)
- Spezies Escherichia-Virus K30
- Spezies Klebsiella-Virus K5
- Spezies Klebsiella-Virus K11
- Spezies Klebsiella-Virus Kp1
- Spezies Klebsiella-Virus KP32 (*)
- Spezies Klebsiella-Virus KpV289
- Gattung Teetrevirus
- Spezies Escherichia virus T3 (*)
- Gattung Teseptimavirus (alias T7virus, T7likevirus, T7-ähnliche Viren)
- Spezies Escherichia-Virus T7 (alias Enterobacteria-Phage T7, *)
- Spezies Kluyvera-Virus Kvp1 (alias Kluyvera-Phage Kvp1)
- Spezies Pseudomonas-Virus gh1 (alias Pseudomonas-Phage gh-1)
- Gattung Troedvirus
- Spezies Pseudomonas virus Phi15 (*)
- Gattung Unyawovirus
- Spezies Pectobacterium virus DUPPII (*)
- ohne zugewiesene Unterfamilie (Auswahl):
- Gattung Aegirvirus
- Spezies Synechococcus virus SCBP42 (*)
- Gattung Pradovirus
- Spezies Xanthomonas-Virus f20
- Spezies Xanthomonas-Virus f30
- Spezies Xylella-Virus Prado (*)
- Gattung Tiamatvirus
- Spezies Prochlorococcus-Virus PSSP7 (alias Prochlorococcus-Phage P-SSP7, *)
- Gattung Tiilvirus
- Spezies Synechococcus-Virus P60 (alias Synechococcus-Phage P60, *)
- Gattung Voetvirus
- Spezies Synechococcus-Virus Syn5 (alias Synechococcus-Phage syn5, *)
Typusspezies sind mit ‚*‘ markiert.
Noch eine weitere vorgeschlagene Gruppe in dieser Familie sind die Cyanopodoviren (vorgeschlagene Gattung ‚Cyanopodovirus‘), deren Ähnlichkeit zu Escherichia-Virus T7 (alias Coliphage T7) eine Zuordnung zu den Autographiviridae(Unterfamilie Studiervirinae) nahelegt.[7][8]
Einzelnachweise
- ↑ a b c d ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b c Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 29. Dezember 2018.
- ↑ ICTV: Virus Taxonomy. Abgerufen am 29. Dezember 2018.
- ↑ D. Scholl, J. Kieleczawa, P. Kemp, J. Rush, C. C. Richardson, C. Merril, S. Adhya, I. J. Molineux: Genomic analysis of bacteriophages SP6 and K1-5, an estranged subgroup of the T7 supergroup. In: Journal of Molecular Biology. Band 335, Nr. 5, 2004, S. 1151–1171, doi:10.1016/j.jmb.2003.11.035, PMID 14729334.
- ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
- ↑ a b c d R. Abbasifar, A. M. Kropinski, P. M. Sabour, H. W. Ackermann, A. Alanis Villa, A. Abbasifar, M. W. Griffiths: The Genome of Cronobacter sakazakii Bacteriophage vB_CsaP_GAP227 Suggests a New Genus within the Autographivirinae. In: Genome Announc. Band 1, Nr. 1, 2013, doi:10.1128/genomeA.00122-12, PMID 23409275, PMC 3569369 (freier Volltext).
- ↑ S. J. Labrie, K. Frois-Moniz, M. S. Osburne, L. Kelly, S. E. Roggensack, M. B. Sullivan, G. Gearin, Q. Zeng, M. Fitzgerald, M. R. Henn, S. W. Chisholm: Genomes of marine cyanopodoviruses reveal multiple origins of diversity. In: Environ. Microbiol. Band 15, Nr. 5, 2013, S. 1356–1376, doi:10.1111/1462-2920.12053, PMID 23320838 (mit.edu [PDF]).
- ↑ Stephen T. Abedon, Richard Calendar (Hrsg.): The Bacteriophages. 2. Auflage. Oxford University Press, 2005, ISBN 0-19-803385-0, S. 518f. (books.google.de)