بین دونگ قهرمان لیگ ۲۰۰۸ ویتنام وفینالیستهای ای اف سی کاپ ۲۰۰۸ یعنی المحرق بحرین و صفاء لبنان میتوانند در مرحلهٔ مقدماتی شرکت کنند ولی معیارهای شرکت در لیگ قهرمانان را ندارند.
قرعه کشی مرحله گروهی ۷ ژانویه ۲۰۰۹ در ابوظبی امارات انجام خواهد شد. هر باشگاه دو بار به صورت رفت و برگشت در برابر سه تیم دیگر عضو گروه بازی میکند و در کل شش بازی انجام خواهد داد. هر باشگاه سه امتیاز برای برد، یک امتیاز برای مساوی و صفر امتیاز برای باخت دریافت میکند. هر باشگاه بر اساس امتیازات بدست آمده رتبهبندی میشود و در صورت تساوی از دستورات زیر پیروی خواهد شد.
بیشتربودن امتیاز بدست آمده در بازیهای گروهی بین دو تیم مربوطه
نتیجه تفاضل گل در بازیهای گروهی بین دو تیم مربوطه (شامل نشدن گلهای بیرون خانه)
بیشتر بودن گلهای به ثمر رسیده در بازیهای گروهی بین دو تیم مربوطه (شامل نشدن گلهای بیرون خانه)
تفاضل گل در همهٔ بازیهای گروهی
بیشتر بودن گلهای به ثمر رسیده در همهٔ بازیهای گروهی
ضرباتی که از نقاط پنالتی دو تیم در میدان بازی وارد دروازه هم کردهاند
کمتر بودن بر اساس محاسبه تعداد کارتهای زرد و قرمز دریافت شده در بازیهای گروهی (یک امتیاز برای هر کارت زرد و۳ امتیاز برای هر کارت قرمز، همچنین دو کارت زرد یک کارت قرمز محسوب خواهد شد، سه امتیاز برای کارت قرمز مستقیم، ۴ امتیاز برای یک کارت زرد به همراه کارت قرمز مستقیم)
قرعه کشی بین دو تیم
تیمهای اول و دوم هر گروه به دور بعد صعود خواهند کرد.