FOXF1

FOXF1
Ідентифікатори
Символи	FOXF1, ACDMPV, FKHL5, FREAC1, forkhead box F1
Зовнішні ІД	OMIM: 601089 MGI: 1347470 HomoloGene: 1114 GeneCards: FOXF1
Пов'язані генетичні захворювання
	alveolar capillary dysplasia
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• transcription regulator complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• somitogenesis; • regulation of smooth muscle cell differentiation; • renal system development; • ureter development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • lung morphogenesis; • embryonic foregut morphogenesis; • lung development; • positive regulation of cell migration; • endocardial cushion development; • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound; • extracellular matrix organization; • cardiac left ventricle morphogenesis; • in utero embryonic development; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of mast cell degranulation; • smooth muscle cell differentiation; • morphogenesis of a branching structure; • venous blood vessel development; • cellular response to cytokine stimulus; • right lung morphogenesis; • transcription, DNA-templated; • васкулогенез; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • respiratory tube development; • heart development; • determination of left/right symmetry; • establishment of epithelial cell apical/basal polarity; • blood vessel development; • embryonic ectodermal digestive tract morphogenesis; • positive regulation of mesenchymal cell proliferation; • embryonic digestive tract morphogenesis; • animal organ morphogenesis; • pancreas development; • detection of wounding; • mesenchyme migration; • smoothened signaling pathway; • lateral mesodermal cell differentiation; • lung alveolus development; • digestive tract development; • lung vasculature development; • mesoderm development; • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis; • negative regulation of inflammatory response; • lung lobe morphogenesis; • ductus arteriosus closure; • embryonic digestive tract development; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • epithelial cell differentiation involved in mammary gland alveolus development; • midgut development; • positive regulation of cell-substrate adhesion; • transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • cell-cell adhesion; • trachea development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2294
	15227
	ENSG00000103241
	ENSMUSG00000042812
	Q12946
	Q61080
	NM_001451
	NM_010426
	NP_001442
	NP_034556
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FOXF1 (англ. Forkhead box F1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 379 амінокислот, а молекулярна маса — 40 122^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSAPEKQQP	PHGGGGGGGG	GGGAAMDPAS	SGPSKAKKTN	AGIRRPEKPP
YSYIALIVMA	IQSSPTKRLT	LSEIYQFLQS	RFPFFRGSYQ	GWKNSVRHNL
SLNECFIKLP	KGLGRPGKGH	YWTIDPASEF	MFEEGSFRRR	PRGFRRKCQA
LKPMYSMMNG	LGFNHLPDTY	GFQGSAGGLS	CPPNSLALEG	GLGMMNGHLP
GNVDGMALPS	HSVPHLPSNG	GHSYMGGCGG	AAAGEYPHHD	SSVPASPLLP
TGAGGVMEPH	AVYSGSAAAW	PPSASAALNS	GASYIKQQPL	SPCNPAANPL
SGSLSTHSLE	QPYLHQNSHN	APAELQGIPR	YHSQSPSMCD	RKEFVFSFNA
MASSSMHSAG	GGSYYHQQVT	YQDIKPCVM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Hellqvist M., Mahlapuu M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1996). Differential activation of lung-specific genes by two forkhead proteins, FREAC-1 and FREAC-2. J. Biol. Chem. 271: 4482—4490. PMID 8626802 DOI:10.1074/jbc.271.8.4482
Mahlapuu M., Pelto-Huikko M., Aitola M., Enerbaeck S., Carlsson P. (1998). FREAC-1 contains a cell-type-specific transcriptional activation domain and is expressed in epithelial-mesenchymal interfaces. Dev. Biol. 202: 183—195. PMID 9769171 DOI:10.1006/dbio.1998.9010
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з FOXF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3809 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-04 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q12946 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з FOXF1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3809 (англ.) . Архів оригіналу за 4 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-04 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q12946 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Література

Примітки

Див. також

Pfad - The Proxy pFad of © 2024 Garber Painting. All rights reserved.